2014年7月和12月，四川仁寿县疾病预防控制中心分别对黑龙滩水库进行了枯水期、丰水期的水质监测。每次监测均GPS定位五里桥、长岛、白果坝、大坝主航道和两河口五个断面，每个监测断面按照左、中上、中中、中下、右设5个采样点，两次监测共采集水样50件，获得了1500个监测数据。
监测结果表明：黑龙滩水库水质总体良好，监测结果基本符合GB3838—2002《地表水环境质量标准》Ⅱ类(主要适用于集中式生活饮用水地表水源地一级保护区等)要求。
2015年，仁寿县疾控中心将继续加强黑龙滩水库水质监测工作，并调整监测方案，一是增加花屋基眉山市取水口、荫溪沟仁寿县取水口两个监测断面，二是增加监测频次，由每半年监测一次调整为每季度一次。通过定期定点连续水质监测，为全域安全饮水做出更大的贡献。
