科学仪器设备是科学发展和技术创新的重要支撑条件。在我国相关科技发展规划和科技计划的支持下，科学仪器设备产业已经具有一定规模，并形成具有我国特色、适应我国市场需求的产品和技术储备。但是，跨国公司在我国设立科学仪器研发和生产基地，不仅垄断了高端产品市场，而且向中低端产品市场渗透，挤压了我国科学仪器设备生产企业的生存空间。
1、跨国科学仪器设备公司在中国的扩张
我国已经成为跨国科学仪器设备公司的重要市场，其在华业务的增速明显快于全球平均水平。以德国耶拿分析仪器股份公司为例，从进入我国市场至2009年的8年间，其销售额增长了10倍，2009年增长率为65%，而其全球增长率为35%。
同时，他们纷纷在华建立独资生产企业。例如岛津国际贸易(上海)有限公司的独资企业引入日本岛津公司的生产技术质量管理体系，关键零部件在日本加工，其他在我国采购，现在已经成为岛津公司的全球生产基地之一，生产的分析仪器70%供应中国市场，30%供应美国和欧洲市场。
为了开发针对中国市场的产品，跨国公司纷纷在华设立研发基地，与我国大学和研究机构合作。他们往往每年支持若干个项目，研发周期为1年左右，支付研发经费2万～3万美元，主要目的是了解大学的科研前沿和科学发现，收购大学教授的研发创意。例如不少企业在与中国科学院的合作中，主要是对其拥有的发明专利感兴趣。应该说，跨国公司在我国早期利用产品赚钱，现在是利用我国的人力资源、知识资源赚钱。
跨国公司的另一个重要发展方向，是提供系统解决方案，快速响应突发事件。随着现代社会对于产品质量、食品和环境安全、公共安全的要求越来越高，那些只能对符合标准要求的样品做出准确测量的单件仪器，已经无法满足解决现实社会所面对的多种多样问题的要求。为解决重大社会突发事件提供支撑，已成为各大仪器公司争取更大市场份额的法宝。有些跨国公司已针对食品安全、环境质量监控、药物开发和药品质量监控、电力、水泥、冶金、石化行业全流程监控提供各自的整体解决方案。对于生命科学研究与医学方面的需求，跨国公司不仅提供从取样、样品前处理到检测分析等一系列仪器、设备和配套试剂，还提供一些外部采购解决方案、实验室设计与启动等服务，这些均构成跨国公司的核心竞争力。
跨国公司的这些特点，对我国科学仪器设备产业产生了挤压。比如跨国公司垄断高端产品市场，向中低端产品渗透，影响到国内企业的产品销售。但同时，跨国公司难以产生直接的技术溢出。科学仪器研发涉及物理、化学、电子、机械等学科，缺少任何一个学科，研发都不可能获得成功。而且跨国公司的科学仪器研发采用分散式结构，因此单个技术人员的流动难以带走关键技术。
不过也应承认，跨国公司在间接技术溢出、质量管理体系的影响和人才流动上，对国内科研设备公司有一些有利影响。而且，跨国公司的研发基地提供了一个使我国相关企业与全球连通的渠道，把我国与世界其他地区用户、技术连接起来，以其全球化的视野影响着我国科学仪器产业的发展方向。
2、我国相关产业的现状分析
目前，我国科学仪器设备产业具备一定规模。2013年，科学仪器大行业企业数已达1439家，主营业务收入为2522亿元;出口交货值为544.5亿元，每家企业的平均利润为1580.7万元(由于没有单独的科学仪器设备产业统计数据，本文采用中国仪器仪表行业协会的“仪器仪表行业主要经济指标”的数据)，主要生产中低端科学仪器产品，正在研发的高端产品主要有质谱仪等。近20年来，在国家科技计划资助下，我国也形成了具有特色的技术基础。
首先，发明专利集中在监测检测专用仪器、光谱仪器和色谱仪器等领域。“九五”和“十五”期间，国家科技攻关计划资助了一些科学仪器研发项目;“十一五”时期，国家科技支撑计划中设立了《科学仪器设备研制与开发》重大项目;“十二五”时期，中央财政设立国家重大科学仪器设备开发专项资金资助重大科学仪器设备的开发。“九五”至“十一五”期间，国家科技攻关和科技支撑计划资助的69项、87项和77项科学仪器研发课题，分别获得授权发明专利34件、45件和20件，正在申请的发明专利分别为9件、32件和38件;获得发明专利授权的课题分别占课题总数的23.19%、29.89%和12.99%，申请发明专利的课题数分别占课题总数的10%、19%和29%。获得发明专利位于前三位的是环境污染和工业生产专用监测检测仪器、光谱仪器、色谱仪器的关键部件，分别为15件、12件和7件，合计占发明专利授权总数的68%。
